3 Biomedische Laboratoriumtechnologie - 3FBT - Onderdelen - Biochemische technologie    Component behoort tot O.O.: De stap naar het onderzoek Afstudeerrichting: BL:Biomedische Laboratoriumtechnologie Code: 30306 Academiejaar: 2010-2011 Type: kern Niveau: gespecialiseerd Programmajaar: 3 Periode binnen het modeltraject: Periode 7 Aantal studiepunten: nvt Wegingscoëfficient: 56 Totaal aantal contacturen: 54 Totaal studietijd: 131,04 Deeltijds programma: Vrijstelling of overdracht: niet mogelijk Onderwijstaal: Nederlands Lector(en): Partoens Peter   KORTE OMSCHRIJVING De rode draad doorheen de component "Biochemische technologie" is "de weg van gen tot eiwit" en sluit hierdoor zeer nauw aan bij het opleidingsonderdeel "Moleculaire genetica". In de component "Biochemische technologie" worden de methoden besproken om cellen en weefsels te homogeniseren. De werking van verschillende detergenten en de mogelijke strategie voor nucleïnezuur- en eiwitzuivering worden behandeld. Alle technieken die hierbij aan bod komen (fractionatie, concentratiebepaling, bufferwissel, concentrering,enz…) worden in theorie gezien en in het opleidingsonderdeel "geïntegreerd lab" toegepast. Nadruk wordt hierbij gelegd op de voorzorgen die nodig zijn om bv. denaturatie te voorkomen. Verder komen de diverse chromatografische en elektroforetische scheidingstechnieken aan bod en de toepassingen die ze in praktijk hebben. De theorie van deze component en het "Geïntegreerd lab" zijn zeer nauw met elkaar verweven. COMPETENTIEGERICHTE LEERDOELEN  Dit opleidingsonderdeel draagt in het bijzonder bij tot het realiseren van volgende opleidingsdoelen (eindtermen) Algemene competenties Algemene beroepsgerichte competenties BL239 Brengt structuur in ideeën Beroepsspecifieke competenties BL361 Heeft een vakoverschrijdende en geïntegreerde kennis omvattende de verschillende aspecten van de biomedische wetenschappen BL366 Heeft inzicht in eenvoudige wetenschappelijke onderzoekstechnologieën BL367 Bezit operationele kennis van de voornaamste biochemische en celbiologische technologieën SPECIFIEKE DOELSTELLINGEN kent de strategie, de methoden en de technieken om een eiwit te maken via recombinant DNA-technologie. kent de algemeen gebruikte scheidingstechnieken voor nucleïnezuren en eiwitten. kent de belangrijkste chromatografische en elektroforetische technieken, de apparatuur die daarbij gebruikt wordt en de belangrijkste toepassingen. kent de typische biochemische werkwijzen als homogenisatie, fractionering, dialyse, membraanfiltratie, blotten en centrifugatie en de apparatuur die hierbij gebruikt wordt. kent de algemeen gebruikte identificatietechnieken voor eiwitten en nucleïnezuren als o.m. de verschillende kleurreacties, autoradiografie en immunochemische detectie. gebruikt onder begeleiding, een vakoverschrijdende en geïntegreerde kennis en deskundigheid in gentechnologie, biochemie, enzymologie, immunologie, microbiologie, bioinformatica en analysetechnieken, om een eiwit via recombinant DNA-technologie aan te maken. ontwikkelt onder begeleiding, nieuwe procedures om eiwitten en nucleïnezuren te zuiveren en te karakteriseren en hierbij de juiste technieken en apparatuur gebruiken. is in staat deze technieken in diverse sectoren (biomedische sector, landbouw, voeding, milieu …) toe te passen. volgt de veiligheids- en afvalverwerkingsvoorschriften nauwgezet op bezit een ethisch onderbouwd verantwoordelijkheidsgevoel LEERINHOUDEN Dit opleidingsonderdeel bestaat uit drie grote delen: biochemische werkwijzen, elektroforese en chromatografie. Biochemische werkwijzen Water, diverse stoffen en buffers Eigenschappen van water Invloed van diverse stoffen Homogenisatie van cellen en weefsels Uitgangsmateriaal Activiteit van hydrolytische enzymen Homogenisatiemethoden Zuivering van en werken met nucleïnezuren Algemene strategie bij zuivering nucleïnezuren Beschadiging van nucleïnezuren Concentratiebepaling Denaturatie en renaturatie Isolatie en zuivering Zuiverheid - Identificatie Zuivering van en werken met eiwitten Algemene strategie bij zuivering eiwitten Efficiëntie van de zuiveringsstap Fractionering Verwijdering van zouten Bewaring Maken van een eiwitoplossing Detectie van denaturatie       2.   Elektroforese           Basisprincipes elektroforese  Inleiding Experimentele aspecten          Elektroforese van eiwitten Inleiding Polyacrylamidegel elektroforese Iso-elektrofocussing 2D-elektroforese Elektroforese van nucleïnezuren Inleiding Gelkeuze Detectie Submarine elektroforese Sequentie- en genoomanalyse RNA-elektroforese Pulsed field lektroforese Adsorptie aan membranen - blotten Voordelen van blotten Technieken Membraantypen   3.Chromatografie           Chromatografie Inleiding Begrippen en formules Oplossend vermogen van een kolom Indeling Apparatuur Oefeningen          Gelfiltratiechromatografie Principe Samenstelling van de gelkorrels Zwellen van gelkorrels Verwijderen van lucht Kwantitatieve benadering Fractioneringsbereik Oplossend vermogen Toepassingen Praktische uitvoering Oefeningen Ionenchromatografie Inleiding Elektrostatische aantrekking Ionenuitwisseling Selectiviteitsconstante Ionenuitwisselaars Ionenchromatografie Oefeningen Affiniteitschromatografie Principe Matrix Ligand Spacerarm Elutie Kolomkeuze en stockeren van het gel Oefeningen Hydrofobe interactiechromatografie Principe Uitvoering          Toepassingen STUDIEMATERIAAL cursus "Biochemische technologie" delen biochemische werkwijzen, elektroforese en chromatografie" – auteur: Peter Partoens– Plantijnhogeschool 2010. powerpoint presentaties van alle lessen zijn beschikbaar op e-campus - auteur: Peter Partoens – Plantijnhogeschool 2010. manualen en catalogen van verschillende firma’s. aanbevolen websites staan bij de verschillende hoofdstukken van de cursus vermeld. cursus "Bio-informatica" op e-campus– auteur: Peter Partoens – Plantijnhogeschool 2010.   WERKVORMEN Soort werkvorm uren   % hoor- en werkcolleges: 50  lesuren   27,93 practicum en oefeningen:  lesuren   00,00 vormen van groepsleren:  lesuren   00,00 studietijd buiten contacturen: 125  klokuren   69,83 Verdere toelichting: EVALUATIE Eerste examenperiode toetsing INT7-1, tijdens de examenperiode: het examen bestaat uit een schriftelijk (50%) en mondeling gedeelte (50%)  het mondeling gedeelte mag gedurende een korte periode schriftelijk voorbereid worden op het mondeling als het schriftelijk examen worden zowel kennis-, inzichts- als toepassingsvragen gesteld en gepeild naar het redeneervermogen van de student. - dit cijfer wordt (in consensus) toegekend door de lectorengroep van het opleidingsonderdeel op basis van de op de verschillende componenten verworven punten - het aantal punten is in principe het gewogen gemiddelde van de verschillende vakdisciplines waarbij de uren sbu als wegingscoëfficiënten gebruikt worden maar kan aangepast worden volgens volgende criteria:    - niet voldoen aan de vooropgestelde leerdoelen     - niet uitvoeren van individuele taken    - niet voldoen aan vooropgestelde gedragsindicatoren van de beoordeelde kerncompetenties   tijd voor examinering uren 4 %    02,23 Tweede examenperiode 2de zittijd: analoog examen als in 1ste zittijd.