3 Chemie - 3BI - Onderdelen - Gentechnologie    Component behoort tot O.O.: Genexpressie, functie en werking Afstudeerrichting: CH:Chemie Code: 30176 Academiejaar: 2010-2011 Type: kern Niveau: uitdiepend Programmajaar: 3 Periode binnen het modeltraject: Periode 7 Aantal studiepunten: nvt Wegingscoëfficient: 56 Totaal aantal contacturen: 29 Totaal studietijd: 87,36 Deeltijds programma: Vrijstelling of overdracht: niet mogelijk Onderwijstaal: Nederlands Lector(en): Pittois Karen   KORTE OMSCHRIJVING Dit vak wordt ingeleid met een korte herhaling van de opbouw van ons erfelijk materiaal. De techniek PCR voor de amplificatie van dit erfelijk materiaal wordt uitgebreid behandeld.  Er wordt kennis gemaakt met de technieken en enzymen uit de recombinant DNA technologie. Aanmaak van recombinant DNA wordt besproken, de productie van cDNA bibliotheken en het gebruik van universele kloneringstechnieken. Verder wordt er een introductie gegeven tot de recombinante expressie in prokaryoten en eurkaryoten. Er worden technieken bestudeerd om de expressie van genen uit te schakelen op drie  niveaus (gen-, RNA- en eiwitniveau). COMPETENTIEGERICHTE LEERDOELEN  Dit opleidingsonderdeel draagt in het bijzonder bij tot het realiseren van volgende opleidingsdoelen (eindtermen) Algemene competenties CH101 zoekt opheldering door het stellen van vragen Algemene beroepsgerichte competenties Beroepsspecifieke competenties SPECIFIEKE DOELSTELLINGEN ·     ·          Beschrijft het principe van de PCR reactie, de vereisten en de risico’s en de mogelijke detectiesystemen ·          Benoemt de verschillende componenten van een PCR reactie en berekent de hoeveelheden ·          Benoemt en beschrijft varianten en alternatieven voor PCR en hun toepassingen ·          Kiest de juiste PCR variant voor een gegeven toepassing ·          Benoemt en beschrijft kwantitatieve PCR procedures en kan deze beschrijven ·          Benoemt de verschillende enzymen die gebruikt worden in de gentechnologie en hun toepassingen en beschrijft hun werking ·          Kiest het juiste enzym voor een gentechnologische toepassing ·          Gebruikt de verschillende notaties voor nucleotiden ·          Geeft de verschillende stappen voor de aanmaak van recombinant DNA ·          Duidt de juiste vector aan voor een moleculaire klonering ·          Geeft de verschillende stappen in de aanmaak van een cDNA –bibliotheek ·          Beschrijft de werking van de toegelichte commerciële kloneringssystemen adhv een schema ·          Somt de verschillende stappen op voor de aanmaak van eiwitten in een prokaryoot expressiesysteem ·          Tekent een prokaryote expressievector en benoemt de verschillende noodzakelijke en optionele onderdelen ·          Legt uit hoe induceerbare expressiesystemen werken en waarom ze gebruikt worden ·          Geeft toelichting bij de verschillende eukaryote expressiesystemen adhv een schema ·          Benoemt en beschrijft de technieken waarmee men genactiviteit kan stilleggen voor elke niveau waarop dit mogelijk is (DNA-RNA-eiwit) ·          Tekent schema’s van ALLE verschillende besproken technieken LEERINHOUDEN -           PCR: principe, vereisten, componenten van de reactie, risico’s en analyse van de genproducten -           PCR: Varianten en alternatieven: hot start, touch down, nested PCR, RT-PCR, e-PCR, PCR-SSCP, ASO-PCR -           Kwantitatieve PCR: competitieve PCR en real time PCR -           Enzymen gebruikt in de gentechnologie en hun toepassingen -           Verschillende notaties voor nucleotiden -           Verschillende vectoren en hun gebruik -           Aanmaak van recombinant DNA (moleculaire klonering) en transformatie o         Blauw-wit screening o         Aanmaak van cDNA bibliotheken o    Screening van DNA bibliotheken o         Universele kloneringstechnieken -           Recombinante expressie in prokaryoten: o         Klonering, transformatie en zuivering -           Expressie in eukaryote systemen: o         Expressie in gist o         Expressie in dierlijke cellen o         Celvrije systemen -           Induceerbare expressiesystemen -           Gene silencing op 3 niveaus: o         Geninactivatie o         Post-transcriptionele inactivatie: inactivatie van RNA o         Eiwit-inactivatie STUDIEMATERIAAL Powerpoint slides beschikbaar op e-campus. Niet verplichte boeken te raadplegen in de bibliotheek: From Genes to Genomes. JW Dale, M van Schantz. 2003. ISBN 978-0-4714-9782-0. Principles of Gene Manipulation. RW Old, SB Primrose. 7de ed. 2007. ISBN 1405135441.(6de editie beschikbaar in PDF) Medical Genetics at a Glance. 2nd ed. D.J. Pritchard, B.R. Korf. Blackwell Publishing.ISBN 978 1 4051 4846 7 WERKVORMEN Soort werkvorm uren   % hoor- en werkcolleges: 28  lesuren   30,11 practicum en oefeningen: 0  lesuren   00,00 vormen van groepsleren: 0  lesuren   00,00 studietijd buiten contacturen: 64  klokuren   68,82 Verdere toelichting:     EVALUATIE Eerste examenperiode toetsing INT7-1, tijdens de examenperiode het examen bestaat uit een schriftelijk en mondeling gedeelte. het mondelinge gedeelte mag gedurende een korte periode schriftelijk voorbereid worden. op het mondeling als het schriftelijke examen worden zowel kennis-, inzichts- als toepassingsvragen gesteld en gepeild naar het redeneervermogen van de student. Berekening van het cijfer voor het opleidingsonderdeel   - dit cijfer wordt (in consensus) toegekend door de lectorengroep van het opleidingsonderdeel op basis van de op de verschillende componenten verworven punten - het aantal punten is in principe het gewogen gemiddelde van de verschillende vakdisciplines waarbij de uren sbu als wegingscoëfficiënten gebruikt worden maar kan aangepast worden volgens volgende criteria:    - niet voldoen aan de vooropgestelde leerdoelen    - afwezigheid tijdens de verplichte praktijksessies, werkcolleges en oefeningenlessen    - niet uitvoeren van individuele taken    - niet voldoen aan vooropgestelde gedragsindicatoren van de beoordeelde kerncompetenties tijd voor examinering uren 1 %    01,08 Tweede examenperiode Idem